MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187086	ACTG	2	8	82	89	25 %	25 %	25 %	25 %	409249434
2	NT_187086	GTTG	2	8	175	182	0 %	50 %	50 %	0 %	409249434
3	NT_187086	CCA	2	6	252	257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249434
4	NT_187086	AGC	2	6	282	287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249434
5	NT_187086	GCC	2	6	374	379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249434
6	NT_187086	CGG	2	6	403	408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249434
7	NT_187086	CAG	2	6	531	536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249434
8	NT_187086	CTT	2	6	666	671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249434
9	NT_187086	TA	3	6	795	800	50 %	50 %	0 %	0 %	409249434
10	NT_187086	ATG	2	6	872	877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249434
11	NT_187086	GGA	2	6	917	922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249434
12	NT_187086	AATTT	2	10	1161	1170	40 %	60 %	0 %	0 %	409249434
13	NT_187086	GAC	2	6	1211	1216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249434
14	NT_187086	CAGC	2	8	1234	1241	25 %	0 %	25 %	50 %	409249434
15	NT_187086	TGT	2	6	1267	1272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249434
16	NT_187086	TA	3	6	1338	1343	50 %	50 %	0 %	0 %	409249434
17	NT_187086	CTG	2	6	1440	1445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249434
18	NT_187086	CAA	2	6	1476	1481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249434
19	NT_187086	TGGG	2	8	1523	1530	0 %	25 %	75 %	0 %	409249434
20	NT_187086	TGGC	2	8	1534	1541	0 %	25 %	50 %	25 %	409249434
21	NT_187086	GAT	2	6	1554	1559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249434
22	NT_187086	A	6	6	1581	1586	100 %	0 %	0 %	0 %	409249435
23	NT_187086	TGA	2	6	1605	1610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249435
24	NT_187086	AAC	2	6	1624	1629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249435
25	NT_187086	A	6	6	1690	1695	100 %	0 %	0 %	0 %	409249435
26	NT_187086	TCCGT	2	10	1727	1736	0 %	40 %	20 %	40 %	409249435
27	NT_187086	AGA	2	6	1740	1745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249435
28	NT_187086	TC	3	6	1748	1753	0 %	50 %	0 %	50 %	409249435
29	NT_187086	GTT	2	6	1777	1782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249435
30	NT_187086	TGT	2	6	1845	1850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249435
31	NT_187086	CGAAC	2	10	1936	1945	40 %	0 %	20 %	40 %	409249435
32	NT_187086	CGA	2	6	1965	1970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249435
33	NT_187086	ATGG	2	8	1992	1999	25 %	25 %	50 %	0 %	409249435
34	NT_187086	TAA	2	6	2089	2094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249435
35	NT_187086	A	6	6	2151	2156	100 %	0 %	0 %	0 %	409249436
36	NT_187086	TAA	2	6	2168	2173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249436
37	NT_187086	TTCAG	2	10	2196	2205	20 %	40 %	20 %	20 %	409249436
38	NT_187086	TGA	2	6	2213	2218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249436
39	NT_187086	ATA	2	6	2222	2227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249436
40	NT_187086	GTT	2	6	2255	2260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249436
41	NT_187086	AAC	2	6	2280	2285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249436
42	NT_187086	CAT	2	6	3238	3243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249437
43	NT_187086	CCG	2	6	3250	3255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249437
44	NT_187086	C	7	7	3282	3288	0 %	0 %	0 %	100 %	409249437
45	NT_187086	A	6	6	3306	3311	100 %	0 %	0 %	0 %	409249437
46	NT_187086	T	7	7	3320	3326	0 %	100 %	0 %	0 %	409249437
47	NT_187086	GCCG	2	8	3379	3386	0 %	0 %	50 %	50 %	409249437
48	NT_187086	ACG	2	6	3389	3394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249437
49	NT_187086	GGA	2	6	3397	3402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249437
50	NT_187086	CAG	2	6	3409	3414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249437
51	NT_187086	GGA	2	6	3451	3456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249437
52	NT_187086	CATT	2	8	3460	3467	25 %	50 %	0 %	25 %	409249437
53	NT_187086	ACT	2	6	3486	3491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249437
54	NT_187086	TAT	2	6	3522	3527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249437
55	NT_187086	TGC	2	6	3661	3666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249437
56	NT_187086	GGA	2	6	3676	3681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249437
57	NT_187086	ATA	2	6	3705	3710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249437
58	NT_187086	AAT	2	6	3712	3717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249437
59	NT_187086	ATGA	2	8	3767	3774	50 %	25 %	25 %	0 %	409249437
60	NT_187086	ATA	2	6	3786	3791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249437
61	NT_187086	CAA	2	6	3840	3845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249437
62	NT_187086	AAG	2	6	3870	3875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249437
63	NT_187086	CAG	2	6	3957	3962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249437
64	NT_187086	CAA	2	6	3990	3995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249437
65	NT_187086	TTAT	2	8	4005	4012	25 %	75 %	0 %	0 %	409249437
66	NT_187086	AGC	2	6	4039	4044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249437
67	NT_187086	ATG	2	6	4053	4058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249437
68	NT_187086	AGAATC	2	12	4075	4086	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	409249437
69	NT_187086	ACA	3	9	4449	4457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249438
70	NT_187086	TTC	2	6	4508	4513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249438
71	NT_187086	GCG	2	6	4527	4532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249438
72	NT_187086	GCG	2	6	4538	4543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249438
73	NT_187086	ATC	2	6	4544	4549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249438
74	NT_187086	CTG	2	6	4556	4561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249438
75	NT_187086	ACG	2	6	4578	4583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249438
76	NT_187086	CTG	2	6	4655	4660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249438
77	NT_187086	AAT	2	6	4683	4688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249438
78	NT_187086	CAT	2	6	4846	4851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249439
79	NT_187086	CGA	2	6	4958	4963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249439
80	NT_187086	TCA	2	6	5024	5029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249439
81	NT_187086	TGAA	2	8	5090	5097	50 %	25 %	25 %	0 %	409249439
82	NT_187086	T	6	6	5107	5112	0 %	100 %	0 %	0 %	409249439
83	NT_187086	CCTT	2	8	5117	5124	0 %	50 %	0 %	50 %	409249439
84	NT_187086	TGC	2	6	5168	5173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249439
85	NT_187086	CTG	2	6	5192	5197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249439
86	NT_187086	TAA	2	6	5223	5228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249439
87	NT_187086	CCA	2	6	5242	5247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249439
88	NT_187086	TCG	2	6	5291	5296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249439
89	NT_187086	TCG	2	6	5384	5389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249439
90	NT_187086	TTC	2	6	5407	5412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249439
91	NT_187086	CA	3	6	5439	5444	50 %	0 %	0 %	50 %	409249439
92	NT_187086	AGG	3	9	5824	5832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249440
93	NT_187086	T	6	6	5993	5998	0 %	100 %	0 %	0 %	409249440

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.